Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIN3Q5JUX0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPIN3Q5JUX0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms