Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CT47A1Q5JQC4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CT47A1Q5JQC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms