Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM41BQ5BJD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms