Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KHDC3LQ587J8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms