Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1BQ53T94 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms