Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL22Q53GT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms