Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GREB1Q4ZG55 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms