Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAL1Q4LDG9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAL1Q4LDG9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms