Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SVEP1Q4LDE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVEP1Q4LDE5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms