Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LONRF3Q496Y0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF3Q496Y0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms