Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS9Q3SYG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms