Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD9Q3L8U1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD9Q3L8U1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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