Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSPP1Q1MSJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSPP1Q1MSJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSPP1Q1MSJ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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