Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTN1Q16799 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTN1Q16799 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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