Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SGCAQ16586 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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