Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK7Q16549 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
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