Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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CRY1Q16526 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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CRY1Q16526 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRY1Q16526 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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CRY1Q16526 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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