Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPE65Q16518 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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