Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC6Q16204 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC6Q16204 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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