Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM1Q15629 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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