Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC9A3R2Q15599 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A3R2Q15599 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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