Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TAF13Q15543 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF13Q15543 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF13Q15543 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF13Q15543 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF13Q15543 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF13Q15543 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF13Q15543 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms