Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCP1Q15431 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP1Q15431 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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