Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

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Length 812 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC41Q15345 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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