Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNPS1Q15287 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RNPS1Q15287 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNPS1Q15287 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNPS1Q15287 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RNPS1Q15287 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms