Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPAQ15257 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms