Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRLQ15198 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRLQ15198 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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