Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KARSQ15046 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KARSQ15046 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KARSQ15046 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KARSQ15046 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KARSQ15046 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KARSQ15046 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KARSQ15046 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KARSQ15046 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KARSQ15046 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KARSQ15046 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KARSQ15046 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KARSQ15046 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KARSQ15046 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KARSQ15046 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KARSQ15046 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KARSQ15046 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KARSQ15046 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KARSQ15046 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KARSQ15046 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KARSQ15046 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KARSQ15046 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KARSQ15046 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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