Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB3GAP1Q15042 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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