Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PCLAFQ15004 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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PCLAFQ15004 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PCLAFQ15004 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PCLAFQ15004 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PCLAFQ15004 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PCLAFQ15004 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCLAFQ15004 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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