Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1I3Q14994 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1I3Q14994 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1I3Q14994 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
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