Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHD4Q14839 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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CHD4Q14839 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD4Q14839 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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CHD4Q14839 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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CHD4Q14839 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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