Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBX1Q14549 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms