Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms