Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP8Q14114 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP8Q14114 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP8Q14114 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP8Q14114 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP8Q14114 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP8Q14114 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms