Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCARB2Q14108 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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