Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1CQ13936 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1CQ13936 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
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