Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNA1SQ13698 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA1SQ13698 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA1SQ13698 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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