Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRQ13535 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRQ13535 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRQ13535 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRQ13535 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRQ13535 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRQ13535 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATRQ13535 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATRQ13535 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATRQ13535 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATRQ13535 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATRQ13535 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATRQ13535 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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