Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPP1R1AQ13522 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPP1R1AQ13522 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms