Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XRCC4Q13426 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XRCC4Q13426 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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