Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3B2Q13367 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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