Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-203ENST00000525208 691 ntTSL 313□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-205ENST00000557236 631 ntTSL 512.27□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-218ENST00000593103 562 ntTSL 512.06□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-208ENST00000590288 734 ntTSL 412.04□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-203ENST00000585989 568 ntTSL 412.04□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 211.95□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-212ENST00000591697 613 ntTSL 411.89□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-202ENST00000524846 3462 ntTSL 211.87□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-204ENST00000556599 548 ntTSL 311.32□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-217ENST00000592378 533 ntTSL 411.31□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-211ENST00000591255 545 ntTSL 410.73□□□□□ -0.691e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 GSDMD-210ENST00000531173 854 ntTSL 210.31□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.961e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 BCL2L2-PABPN1-202ENST00000556100 655 ntTSL 38.31□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 METTL17-222ENST00000556733 510 ntTSL 57.88□□□□□ -1.151e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.833e-6■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 COL9A3-204ENST00000463487 760 ntTSL 512.14□□□□□ -0.473e-7■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.631e-8■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-8■□□□□ 10.2
SRSF9Q13242 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 34.79□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.221e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.861e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-204ENST00000430075 586 ntTSL 49.55□□□□□ -0.881e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.551e-9■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.593e-7■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 23.23□□□□□ -1.893e-7■□□□□ 10.1
SRSF9Q13242 DHRSX-207ENST00000478825 679 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-202ENST00000412516 744 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-205ENST00000444280 797 ntTSL 210.64□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 DHRSX-204ENST00000441131 539 ntTSL 24.69□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 10
SRSF9Q13242 PDIA4-202ENST00000413966 550 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-14■□□□□ 10
SRSF9Q13242 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.692e-14■□□□□ 10
SRSF9Q13242 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.454e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 FMO5-204ENST00000478432 1606 ntTSL 25.88□□□□□ -1.474e-9■□□□□ 10
SRSF9Q13242 FMO5-207ENST00000533848 618 ntTSL 45.22□□□□□ -1.574e-9■□□□□ 10
SRSF9Q13242 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-201ENST00000413969 545 ntTSL 310.41□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-203ENST00000417086 984 ntTSL 29.38□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 HAGLR-205ENST00000436126 945 ntTSL 47.79□□□□□ -1.162e-7■□□□□ 10
SRSF9Q13242 ACIN1-217ENST00000555566 734 ntTSL 37.42□□□□□ -1.222e-8■□□□□ 10
SRSF9Q13242 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 HS1BP3-206ENST00000446825 841 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.212e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 FKBP10-206ENST00000489591 2826 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 FKBP10-205ENST00000487489 578 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-9■□□□□ 9.9
SRSF9Q13242 PRKAR1A-216ENST00000589017 1116 ntTSL 311.51□□□□□ -0.577e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.17e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 46.19□□□□□ -1.427e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 05e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-206ENST00000531030 805 ntTSL 311.27□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 FOXK2-203ENST00000526383 786 ntTSL 58.57□□□□□ -1.045e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-209ENST00000562396 1681 nt14.5□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-217ENST00000530534 844 ntTSL 211.31□□□□□ -0.63e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.763e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-216ENST00000569900 559 ntTSL 410.12□□□□□ -0.793e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 AP000347.1-206ENST00000437862 515 ntTSL 39.87□□□□□ -0.833e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 49.41□□□□□ -0.93e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-215ENST00000529840 820 ntTSL 57.74□□□□□ -1.173e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-210ENST00000527852 582 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 27.23□□□□□ -1.253e-9■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 MIR194-2-201ENST00000384864 85 ntBASIC6.9□□□□□ -1.33e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-210ENST00000562527 625 ntTSL 36.44□□□□□ -1.383e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ZNF217-203ENST00000431687 779 ntTSL 55.82□□□□□ -1.483e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-217ENST00000569939 564 ntTSL 45.52□□□□□ -1.533e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 34.53□□□□□ -1.683e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 43.41□□□□□ -1.863e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 ATF7IP2-214ENST00000566316 576 ntTSL 21.53□□□□□ -2.163e-7■□□□□ 9.8
SRSF9Q13242 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 9.7
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