Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3BQ13214 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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