Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAF1Q13077 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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TRAF1Q13077 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF1Q13077 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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