Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MKRN3Q13064 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MKRN3Q13064 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MKRN3Q13064 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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