Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN31Q12999 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN31Q12999 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSPAN31Q12999 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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TSPAN31Q12999 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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TSPAN31Q12999 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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TSPAN31Q12999 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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TSPAN31Q12999 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TSPAN31Q12999 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TSPAN31Q12999 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSPAN31Q12999 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPAN31Q12999 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms