Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMAN2Q12907 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN2Q12907 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN2Q12907 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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