Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
STX4Q12846 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
STX4Q12846 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
STX4Q12846 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
STX4Q12846 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
STX4Q12846 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
STX4Q12846 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
STX4Q12846 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
STX4Q12846 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
STX4Q12846 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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