Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TROAPQ12815 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TROAPQ12815 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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